{
    "Identifier": "33AF38D22D490E23052B0311273C598E6F768D3F",
    "Last_Update": "2026-05-03T21:55:50",
    "Source": "MGnify",
    "Title": "EMG produced TPA metagenomics assembly of the Marine microbial communities from the Southern Atlantic ocean transect to study dissolved organic matter and carbon cycling - Knorr_S15_td_NADW_ad_2500m_LV_A metagenome (marine metagenome) data set.",
    "Abstract": "The marine metagenome Third Party Annotation (TPA) assembly was derived from the primary whole genome shotgun (WGS) data set: PRJNA375456.  This project includes samples from the following biomes: Environmental, Aquatic, Marine.",
    "Keywords": [
        "ELIXIR-MGnify"
    ],
    "Parameters": [
        "Bacteria::Proteobacteria:Gammaproteobacteria:Chromatiales:Ectothiorhodospiraceae",
        "Bacteria::Proteobacteria:Gammaproteobacteria:Oceanospirillales:Alcanivoracaceae:Alcanivorax",
        "Bacteria::Proteobacteria:Alphaproteobacteria:Pelagibacterales",
        "Bacteria::Chloroflexi:Anaerolineae:Anaerolineales:Anaerolineaceae",
        "Bacteria::Proteobacteria:Gammaproteobacteria:Alteromonadales:Alteromonadaceae:Alteromonas:Alteromonas_macleodii",
        "Bacteria::Proteobacteria:Alphaproteobacteria",
        "Bacteria::Proteobacteria:Gammaproteobacteria:Oceanospirillales:Halomonadaceae:Halomonas",
        "Eukaryota::::Diplonemida",
        "Bacteria::Nitrospinae:Nitrospinia:Nitrospinales:Nitrospinaceae:Nitrospina:Nitrospina_sp._LS_NOB",
        "Bacteria::Candidatus_Marinimicrobia:::::Marinimicrobia_bacterium_SCGC_AAA003-E22",
        "Bacteria::Gemmatimonadetes:Gemmatimonadetes:Gemmatimonadales:Gemmatimonadaceae:Gemmatimonas",
        "Bacteria::Proteobacteria:Gammaproteobacteria:Alteromonadales:Alteromonadaceae:Alteromonas",
        "Mitochondria",
        "Bacteria::Planctomycetes",
        "Bacteria::Proteobacteria:Alphaproteobacteria:Sphingomonadales:Erythrobacteraceae",
        "Eukaryota",
        "Bacteria::Candidatus_Wildermuthbacteria",
        "Bacteria::Proteobacteria:Gammaproteobacteria",
        "Bacteria::Proteobacteria:Alphaproteobacteria:Pelagibacterales:Pelagibacteraceae::Pelagibacteraceae_bacterium_ETNP-OMZ-SAG-A7",
        "Bacteria::Candidatus_Tectomicrobia",
        "Bacteria::Gemmatimonadetes:Gemmatimonadetes:Gemmatimonadales:Gemmatimonadaceae",
        "Bacteria::Proteobacteria:Gammaproteobacteria:Alteromonadales:Pseudoalteromonadaceae:Pseudoalteromonas",
        "Bacteria::Verrucomicrobia:Verrucomicrobiae",
        "Archaea",
        "Bacteria::Acidobacteria",
        "Bacteria::Proteobacteria:Gammaproteobacteria:::Candidatus_Thioglobus",
        "Eukaryota:::Polycystinea",
        "Bacteria::Proteobacteria:Gammaproteobacteria::::gamma_proteobacterium_SCGC_AB-629-K02",
        "Bacteria::Proteobacteria:Alphaproteobacteria:Rhodobacterales:Rhodobacteraceae:Pelagibaca:Pelagibaca_bermudensis",
        "Bacteria::Proteobacteria:Gammaproteobacteria:Oceanospirillales:Halomonadaceae",
        "Bacteria::Proteobacteria:Gammaproteobacteria:Alteromonadales:Alteromonadaceae:Marinobacter",
        "Bacteria::Proteobacteria:Alphaproteobacteria:Rhodobacterales:Rhodobacteraceae",
        "Archaea::Euryarchaeota",
        "Archaea::Thaumarchaeota",
        "Bacteria::Bacteroidetes:Bacteroidia",
        "Bacteria::Gemmatimonadetes:::::Gemmatimonadetes_bacterium_SCGC_AAA240-J22",
        "Bacteria::Verrucomicrobia:Opitutae:Puniceicoccales",
        "Archaea::Euryarchaeota:Halobacteria",
        "Bacteria::Proteobacteria:Alphaproteobacteria:Rhizobiales",
        "Bacteria::candidate_division_NC10",
        "Bacteria::Chloroflexi:Dehalococcoidia",
        "Bacteria::Verrucomicrobia:Opitutae:Puniceicoccales:Puniceicoccaceae",
        "Bacteria::Bacteroidetes:Flavobacteriia:Flavobacteriales:Flavobacteriaceae",
        "Bacteria::Chloroflexi",
        "Bacteria::Bacteroidetes:Cytophagia:Cytophagales",
        "Bacteria::Gemmatimonadetes:Gemmatimonadetes:Gemmatimonadales",
        "Bacteria",
        "Bacteria::Spirochaetes",
        "Bacteria::Bacteroidetes",
        "Bacteria::Chloroflexi:::::SAR202_cluster_bacterium_SCGC_AAA240-N13",
        "Bacteria::Actinobacteria:Acidimicrobiia",
        "Bacteria::Proteobacteria:Gammaproteobacteria:Oceanospirillales:Oceanospirillaceae:Oleibacter",
        "Bacteria::Proteobacteria:Gammaproteobacteria:Pseudomonadales",
        "Bacteria::Planctomycetes:Phycisphaerae:Phycisphaerales:Phycisphaeraceae",
        "Eukaryota:::Polycystinea:Collodaria:Collozoidae:Cladococcus:Cladococcus_viminalis",
        "Bacteria::Proteobacteria:Alphaproteobacteria:Sphingomonadales:Erythrobacteraceae:Erythrobacter",
        "Bacteria::Proteobacteria:Alphaproteobacteria:Pelagibacterales:Pelagibacteraceae",
        "Bacteria::Proteobacteria:Alphaproteobacteria:Rhodobacterales:Rhodobacteraceae:Ruegeria:Ruegeria_mobilis",
        "Bacteria::Nitrospinae:Nitrospinia:Nitrospinales:Nitrospinaceae:Nitrospina",
        "Bacteria::Proteobacteria:Gammaproteobacteria:Thiotrichales",
        "Eukaryota:::Dinophyceae:Syndiniales",
        "Bacteria::Proteobacteria:Deltaproteobacteria",
        "Bacteria::Candidatus_Colwellbacteria",
        "Bacteria::Bacteroidetes:Flavobacteriia:Flavobacteriales:Flavobacteriaceae:Leeuwenhoekiella",
        "Bacteria::Proteobacteria:Alphaproteobacteria:Rhodobacterales",
        "Eukaryota::::Diplonemida::Diplonema",
        "Bacteria::Candidatus_Marinimicrobia",
        "Archaea::Thaumarchaeota::Nitrosopumilales:Nitrosopumilaceae",
        "Bacteria::Proteobacteria:Alphaproteobacteria:Rhodobacterales:Rhodobacteraceae:Sulfitobacter"
    ],
    "Instruments": [
        "561"
    ],
    "Platforms": [
        "308"
    ],
    "Temporal_Extent_Begin": "2019-06-12",
    "Temporal_Extent_End": "2019-06-12",
    "OnlineResourceUrl": "\/search-details?step=~01233AF38D22D490E23052B0311273C598E6F768D3F"
}